Trả lời văn bản số 0110/ĐP-2012 ngày 01/10/2012 của Công ty về khấu trừ thuế nhà thầu, Cục thuế TP có ý kiến như sau:

- Căn cứ Thông tư số 60/2012/TT-BTC ngày 12/04/2012 của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện nghĩa vụ thuế áp dụng đối với tổ chức, cá nhân nước ngoài kinh doanh tại Việt Nam hoặc có thu nhập tại Việt Nam;

- Căn cứ Thông tư số 06/2012/TT-BTC ngày 11/01/2012 của Bộ Tài chính hướng dẫn về thuế GTGT;

- Căn cứ công văn số 3947/TCT-CS ngày 25/9/2009 của Tổng cục Thuế hướng dẫn về việc lập hóa đơn GTGT đối với việc thu hộ các Hãng giao nhận kho vận và chuyển phát nước ngoài:

“ Trường hợp Hãng giao nhận kho vận, chuyển phát nước ngoài hoạt động tại Việt Nam thông qua Đại lý, khi Đại lý đứng ra thu hộ doanh thu cho Hãng nước ngoài thì Đại lý thực hiện xuất hoá đơn cho khách hàng như sau:

- Đại lý ghi rõ trên hoá đơn là tiền thu hộ Hãng nước ngoài, dòng tiền hàng ghi giá trị dịch vụ thanh toán cho Hãng nước ngoài (không bao gồm thuế GTGT), dòng thuế suất thuế GTGT không ghi và gạch chéo, dòng thuế GTGT ghi đúng số thuế GTGT Đại lý khấu trừ nộp thay Hãng nước ngoài …

Trường hợp hoạt động giao nhận kho vận bao gồm cước vận tải quốc tế: việc lập hoá đơn được thực hiện như hướng dẫn nêu trên đối với hai loại khách hàng, trên hoá đơn ghi rõ giá trị dịch vụ thu hộ chịu thuế GTGT và giá trị dịch vụ thu hộ chịu thuế GTGT (cước vận tải quốc tế) với thuế suất 0%.

Khách hàng được sử dụng hoá đơn do Đại lý thu hộ Hãng nước ngoài xuất để khấu trừ thuế GTGT đầu vào theo quy định, kể cả những hoá đơn xuất từ ngày 1/1/2009.”

Trường hợp Công ty cổ phần Hải Minh là đại lý tại Việt Nam của Hãng giao nhận, kho vận nước ngoài (Công ty Samudera) có phát sinh khoản thu hộ, chi hộ dịch vụ giao nhận, kho vận quốc tế cho nhà thầu nước ngoài thì Công ty cổ phần Hải Minh thực hiện xuất hóa đơn cho khách hàng theo hướng dẫn của Tổng cục Thuế tại công văn số 3947/TCT-CS nêu trên. Công ty được sử dụng hóa đơn GTGT này để kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào theo quy định.

Cục Thuế TP thông báo Công ty biết để thực hiện theo đúng quy định tại các văn bản quy phạm pháp luật đã được trích dẫn tại văn bản này.