Tổng cục Hải quan nhận được công văn số 1212/HQQT-NV ngày 25/8/2017 của Cục Hải quan tỉnh Quảng Trị, công văn số 10/TH ngày 30/8/2017 của Công ty CP Đầu tư và Phát triển Trường Hưng đề nghị hướng dẫn xử lý thuế GTGT đối với hàng nhập khẩu sau đó tái xuất sang nước thứ ba. Về vấn đề này, Tổng cục Hải quan có ý kiến như sau:

Căn cứ khoản 1 Điều 156 Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật số 80/2015/QH13, thì: “Văn bản quy phạm pháp luật được áp dụng từ thời điểm bắt đầu có hiệu lực. Văn bản quy phạm pháp luật được áp dụng đối với hành vi xảy ra tại thời điểm mà văn bản đó đang có hiệu lực. Trong trường hợp quy định của văn bản quy phạm pháp luật có hiệu lực trở về trước thì áp dụng theo quy định đó”.

Căn cứ khoản 13 Điều 1 Luật số 21/2012/QH13 sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Quản lý thuế, khoản 1 Điều 29 Nghị định số 83/2013/NĐ-CP ngày 22/7/2013 của Chính phủ, khoản 1 Điều 49 Thông tư số 38/2015/TT-BTC ngày 25/3/2015 của Bộ Tài chính quy định về tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa.

Căn cứ khoản 3 Điều 1 Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật Thuế tiêu thụ đặc biệt và Luật Quản lý thuế số 106/2016/QH13, thì: “Cơ sở kinh doanh trong tháng, quý có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu nếu có số thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ từ ba trăm triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế giá trị gia tăng theo tháng, quý, trừ trường hợp hàng hóa nhập khẩu để xuất khẩu, hàng hóa xuất khẩu không thực hiện việc xuất khẩu tại địa bàn hoạt động hải quan theo quy định của Luật hải quan.”

Căn cứ khoản 3 Điều 1 Thông tư 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016 của Bộ Tài chính.

Căn cứ công văn số 18304/BTC-TCHQ ngày 16/12/2014 của Bộ Tài chính về hoàn trả thuế GTGT hàng nhập khẩu nộp nhầm, nộp thừa.

1. Đối với tờ khai xuất khẩu trước ngày 01/7/2016.

Giao Cục Hải quan tỉnh Quảng Trị, Cục Hải quan tỉnh Quảng Bình phối hợp với cơ quan liên quan (cơ quan thuế, cơ quan kiểm lâm) thực hiện kiểm tra, rà soát toàn bộ hồ sơ nhập khẩu, xuất khẩu, sổ sách chứng từ kế toán, chứng từ thanh toán, hồ sơ lâm sản và các giao dịch có liên quan đến các lô gỗ nhập khẩu sau đó tái xuất sang nước thứ ba của Công ty TNHH MTV Long Đại Tiến, Công ty CP Đầu tư và Phát triển Trường Hưng. Kết quả kiểm tra nếu đủ cơ sở xác định các loại gỗ trên tờ khai xuất khẩu phù hợp về chủng loại, quy cách, phẩm cấp gỗ trên các tờ khai nhập khẩu trước đó; Công ty TNHH MTV Long Đại Tiến, Công ty CP Đầu tư và Phát triển Trường Hưng đã nộp số tiền thuế GTGT ở khâu nhập khẩu nhưng chưa được cơ quan thuế địa phương hoàn trả thì cơ quan hải quan thực hiện hoàn thuế GTGT cho doanh nghiệp theo quy định tại Điều 49, Điều 132 Thông tư 38/2015/TT-BTC ngày 25/3/2015.

Trường hợp Công ty TNHH MTV Long Đại Tiến, Công ty CP Đầu tư và Phát triển Trường Hưng đã kê khai, khấu trừ thuế GTGT với cơ quan thuế nhưng chưa được xử lý hoàn thuế GTGT thì cơ quan hải quan phối hợp với cơ quan thuế liên quan hướng dẫn doanh nghiệp thực hiện kê khai điều chỉnh lại và nộp hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT cho cơ quan hải quan.

2. Đối với tờ khai xuất khẩu từ ngày 01/7/2016.

Cục Hải quan tỉnh Quảng Trị, Cục Hải quan tỉnh Quảng Bình hướng dẫn Công ty TNHH MTV Long Đại Tiến, Công ty CP Đầu tư và Phát triển Trường Hưng thực hiện theo quy định tại khoản 3 Điều 1 Thông tư số 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016.

Tổng cục Hải quan thông báo để Cục Hải quan tỉnh Quảng Trị, Cục Hải quan tỉnh Quảng Bình biết và thực hiện.