Tại điểm 2.11 mục II phần B Thông tư số 129/2008/TT-BTC ngày 26/12/2008 của Bộ Tài chính hướng dẫn về thuế giá trị gia tăng quy định:

“Thiết bị, dụng cụ y tế gồm máy móc và dụng cụ chuyên dùng cho y tế như: các loại máy soi, chiếu, chụp dùng để khám, chữa bệnh; các thiết bị, dụng cụ chuyên dùng để mổ, điều trị vết thương, ô tô cứu thương; dụng cụ đo huyết áp, tim mạch, dụng cụ truyền máu; bơm kim tiêm; dụng cụ phòng tránh thai và các dụng cụ, thiết bị chuyên dùng cho y tế khác;

Bông, băng, gạc y tế và băng vệ sinh y tế; thuốc phòng bệnh, chữa bệnh bao gồm thuốc thành phẩm, nguyên liệu làm thuốc, trừ thực phẩm chức năng; vắc-xin, sinh phẩm y tế, nước cất để pha chế thuốc tiêm, dịch truyền; vật tư hóa chất xét nghiệm, diệt khuẩn dùng trong y tế” thuộc nhóm hàng hóa áp dụng thuế suất thuế GTGT 5%.

Như vậy hàng hóa là khăn (khăn trải bàn, khăn chụp mạch vành, khăn phụ khoa, khăn phẫu thuật mặt, chi, mắt…) bán cho cơ sở y tế để dùng trong phòng mổ không phải là thiết bị, dụng cụ chuyên dùng cho y tế nêu trên nên phải áp dụng thuế suất thuế GTGT 10%. Vấn đề này đã được Tổng cục Thuế trả lời tại công văn số 1613/TCT-CS ngày 14/05/2010 (Cục thuế đã sao gửi đến các Phòng, các Chi cục thuế quận huyện).

Tuy nhiên, theo phản ánh của một số doanh nghiệp, hiện trên địa bàn thành phố vẫn còn một số doanh nghiệp đang áp dụng thuế suất thuế GTGT 5% đối với các mặt hàng khăn nêu trên như: Công ty TNHH Trang thiết bị y tế Thời Thanh Bình (Chi cục thuế quận 8 quản lý), Công ty TNHH SX Bảo Thạch (Chi cục thuế huyện Hóc Môn quản lý); Công ty TNHH Dược phẩm & Trang thiết bị y tế Hoàng Đức (Phòng Kiểm tra thuế số 4 quản lý).

Để việc thực hiện được thống nhất, đúng quy định; Cục thuế đề nghị các Phòng, các Chi cục thuế quận huyện rà soát, kiểm tra lại việc áp dụng thuế suất thuế GTGT đối với mặt hàng khăn để yêu cầu doanh nghiệp thực hiện đúng quy định.

Cục thuế TP thông báo các Phòng, các Chi cục thuế quận huyện biết.