Kính gửi: Cục thuế Thành phố Hà Nội.

Trả lời công văn số 10238/CT-TTR4 ngày 26/3/2014 của Cục thuế Thành phố Hà Nội nêu vướng mắc trong quá trình thanh tra sau hoàn thuế GTGT của Ban Quản lý dự án Nhiệt điện 1 (Ban QLDA), Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Điểm c, Khoản 3 Điều 10 Thông tư số 28/2011/TT-BTC hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Quản lý thuế, hướng dẫn thi hành Nghị định số 85/2007/NĐ-CP ngày 25/5/2007 và Nghị định số 106/2010/NĐ-CP ngày 28/10/2010 của Chính phủ quy định:

“Trường hợp người nộp thuế có dự án đầu tư tại địa bàn tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương khác với tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính, đang trong giai đoạn đầu tư chưa đi vào hoạt động, chưa đăng ký kinh doanh, chưa đăng ký thuế thì người nộp thuế lập hồ sơ khai thuế riêng cho dự án đầu tư và nộp tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp nơi đóng trụ sở chính. Nếu số thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho dự án đầu tư từ 200 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế giá trị gia tăng cho dự án đầu tư. Trường hợp người nộp thuế có quyết định thành lập các Ban Quản lý dự án đóng tại các tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương khác với tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính để thay mặt người nộp thuế quản lý một hoặc nhiều dự án đầu tư tại nhiều địa phương, Ban Quản lý dự án có con dấu theo quy định của pháp luật, lưu giữ sổ sách chứng từ theo quy định của pháp luật về kế toán, có tài khoản gửi tại ngân hàng, đã đăng ký thuế và được cấp mã số thuế phụ thuộc thì Ban quản lý dự án được lập hồ sơ khai thuế riêng với cơ quan thuế địa phương nơi đăng ký thuế.”

Căn cứ các quy định trên và để phù hợp với đặc thù kinh doanh của Tập đoàn Điện lực Việt Nam và Ban Quản lý dự án nhiệt điện 1, Tổng cục Thuế hướng dẫn việc kê khai khấu trừ và hoàn thuế GTGT đối với Ban Quản lý dự án nhiệt điện 1 như sau:

Tập đoàn Điện lực Việt Nam được Bộ Công thương giao nhiệm vụ đầu tư cơ sở hạ tầng Trung tâm Nhiệt điện Mông Dương bao gồm cả hạng mục dùng chung cho các dự án điện thuộc trung tâm và đầu tư Nhà máy Nhiệt điện Mông Dương 1, Tập đoàn bỏ vốn thực hiện đầu tư cơ sở hạ tầng dùng chung của Trung tâm nhiệt điện Mông Dương và sẽ thu hồi thông qua giá mua điện của Công ty BOT theo hợp đồng mua bán điện giữa Tập đoàn và Công ty BOT do Bộ Công thương phê duyệt. Tập đoàn Điện lực Việt Nam giao cho Ban Quản lý dự án Nhiệt điện 1 thực hiện quản lý dự án đầu tư Nhà máy Nhiệt điện Mông Dương 1 bao gồm cả giá trị đầu tư cơ sở hạ tầng của các hạng mục dùng chung thuộc Trung tâm Nhiệt điện Mông Dương (từ 1/1/2013 Ban Quản lý dự án Nhiệt điện 1 và dự án Nhiệt điện Mông Dương 1 được chuyển giao cho Tổng công ty phát điện 3) thì Ban Quản lý dự án Nhiệt điện 1 thực hiện kê khai khấu trừ và hoàn thuế GTGT đầu vào đối với dự án đầu tư Nhà máy Nhiệt điện Mông Dương 1 bao gồm cả các hạng mục dùng chung của Trung tâm điện lực Mông Dương. Tổng cục Thuế trả lời để Cục thuế Thành phố Hà Nội biết và hướng dẫn đơn vị thực hiện./.