Kính gửi: Cục Hải quan tỉnh Long An.

Tổng cục Hải quan nhận được công văn số 2267/HQLA-NV ngày 28/10/2016 của Cục Hải quan tỉnh Long An, công văn số 5581/UBND-TCĐT ngày 21/10/2016 của Ủy ban nhân dân tỉnh Bến Tre và công văn số 73/CV-TP ngày 20/10/2016 của Công ty TNHH CB Nông Sản Thuận Phong kèm hồ sơ về việc miễn thuế máy móc thiết bị nhập khẩu tạo tài sản cố định của Công ty TNHH CB Nông Sản Thuận Phong. Về vấn đề này, Tổng cục Hải quan có ý kiến như sau:

1. Căn cứ khoản 1 Điều 17 Luật đầu tư số 67/2014/QH13 ngày 26/11/2014; khoản 1 Điều 17 Nghị định số 118/2015/NĐ-CP ngày 12/11/2015 của Chính phủ quy định: Ưu đãi đầu tư ghi tại Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, văn bản quyết định chủ trương đầu tư gồm những nội dung về đối tượng và điều kiện hưởng ưu đãi đầu tư theo quy định; căn cứ áp dụng ưu đãi đầu tư theo quy định của pháp luật về thuế;

Căn cứ khoản 2 Điều 17 Nghị định số 118/2015/NĐ-CP quy định: Đối với dự án đầu tư thuộc diện cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc quyết định chủ trương đầu tư, nhà đầu tư căn cứ nội dung ưu đãi đầu tư quy định tại Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc văn bản quyết định chủ trương đầu tư để hưởng ưu đãi đầu tư;

Căn cứ Danh mục địa bàn ưu đãi đầu tư tại Phụ lục II ban hành kèm theo Nghị định số 118/2015/NĐ-CP ngày 12/11/2015 của Chính phủ quy định: Ấp Long Hòa, xã Giao Long, huyện Châu Thành, tỉnh Bến Tre thuộc địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội khó khăn;

Căn cứ khoản 6 Điều 12 Nghị định số 87/2010/NĐ-CP ngày 13/8/2010 của Chính phủ quy định: Thiết bị, máy móc; Linh kiện, chi tiết, bộ phận rời, phụ tùng, gá lắp, khuôn mẫu, phụ kiện đi kèm để lắp ráp đồng bộ với thiết bị máy móc nhập khẩu để tạo tài sản cố định của dự án đầu tư vào lĩnh vực được ưu đãi về thuế nhập khẩu quy định tại Phụ lục 1 ban hành kèm theo Nghị định này hoặc địa bàn được ưu đãi về thuế nhập khẩu được miễn thuế nhập khẩu;

Căn cứ khoản 7 Điều 104 Thông tư số 38/2015/TT-BTC ngày 25/3/2015 của Bộ Tài chính quy định thời điểm đăng ký Danh mục: Trước khi đăng ký tờ khai hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu đầu tiên của dự án, hạng mục, giai đoạn dự án hoặc dự án mở rộng;

Căn cứ điểm b.3 khoản 2 Điều 105 Thông tư 38/2015/TT-BTC quy định trường hợp phải đăng ký Danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế: Cơ quan hải quan chỉ thực hiện miễn thuế đối với trường hợp đăng ký tờ khai hải quan sau khi đăng ký Danh mục. Trường hợp đăng ký tờ khai hải quan phát sinh trước ngày đăng ký Danh mục, Cục trưởng Cục Hải quan nơi làm thủ tục xuất khẩu, nhập khẩu phối hợp với Cục Hải quan có thẩm quyền đăng ký danh mục hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu miễn thuế xem xét giải quyết từng trường hợp cụ thể.

2. Trường hợp Công ty TNHH CB Nông Sản Thuận Phong nhập khẩu 02 bộ máy cấp đông IQF Freezers Octofrost TM Model 3/2LH dùng để chế biến hoa quả, chạy bằng điện, công suất 2000kg/hr, thiết bị mới 100% theo 02 tờ khai số 100912134858/A12 ngày 20/6/2016, số 100941714750 ngày 11/7/2016 cho dự án ưu đãi đầu tư tại thời điểm hiệu lực của Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư số 5327571400 ngày 18/01/2016; Tại Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư này, cơ quan đăng ký đầu tư không ghi nội dung ưu đãi đầu tư theo quy định tại khoản 1 Điều 17 Luật đầu tư số 67/2014/QH13 ngày 26/11/2014, thì đề nghị Công ty liên hệ với cơ quan đăng ký đầu tư để được ghi bổ sung nội dung ưu đãi về thuế nhập khẩu theo quy định tại thời điểm được cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư số 5327571400 ngày 18/01/2016 làm cơ sở cho cơ quan hải quan áp dụng chính sách thuế đối với hàng hóa nhập khẩu của Công ty.

Dự án của Công ty sau khi xác định thuộc đối tượng miễn thuế nhập khẩu theo quy định, Công ty đã đăng ký tờ khai hải quan trước khi đăng ký Danh mục miễn thuế thì Cục trưởng Cục Hải quan nơi làm thủ tục xuất khẩu, nhập khẩu phối hợp với Cục Hải quan có thẩm quyền đăng ký danh mục hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu miễn thuế xem xét giải quyết từng trường hợp cụ thể theo quy định tại điểm b.3 khoản 2 Điều 105 Thông tư 38/2015/TT-BTC.

Trường hợp Công ty TNHH CB Nông Sản Thuận Phong đã nộp thuế nhập khẩu cho hàng hóa thuộc đối tượng miễn thuế nhập khẩu theo quy định thì xử lý tiền thuế nộp thừa theo quy định Điều 49 Thông tư 38/2015/TT-BTC.

Tổng cục Hải quan thông báo để Cục Hải quan tỉnh Long An biết và thực hiện./.