Thuế thu nhập doanh nghiệp đối với doanh nghiệp phần mềm
Công ty TNHH phát triển điện toán Y khoa Hoàng Trung (Công ty TNHH Hoàng Trung) thành lập theo Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh năm 2002, thay đổi lần 2 năm 2007. Công ty chuyên kinh doanh, sản xuất trong lĩnh vực phần mềm. Theo hướng dẫn của Chi cục Thuế quận 4, TP. Hồ Chí Minh, trường hợp Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh của Công ty TNHH Hoàng Trung không ghi cụ thể các mức ưu đãi thì chưa đủ căn cứ để xác định ưu đãi thuế cho doanh nghiệp. Nhưng ông Phan Xuân Trung, Giám đốc Công ty TNHH Hoàng Trung cho rằng, theo Thông tư số 123/2004/TT-BTC ngày 22/12/2004 của Bộ Tài chính, thì các doanh nghiệp phần mềm đều được hưởng ưu đãi về thuế. Ông Trung đề nghị được cơ quan chức năng giải đáp vướng mắc của Công ty.
Mục I Phần B Thông tư số 123/2004/TT-BTC ngày 22/12/2004 của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện ưu đãi về thuế đối với doanh nghiệp phần mềm, quy định:
1. Doanh nghiệp phần mềm mới thành lập được hưởng thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp 10% trong 15 năm, kể từ khi doanh nghiệp phần mềm mới thành lập bắt đầu hoạt động kinh doanh.
2. Doanh nghiệp phần mềm mới thành lập được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 4 năm, kể từ khi có thu nhập chịu thuế và được giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm tiếp theo.
3. Doanh nghiệp phần mềm đã được cấp Giấy phép đầu tư hoặc Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư thì tiếp tục được hưởng ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp đã ghi trong Giấy phép đầu tư hoặc Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư. Trường hợp mức ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp (bao gồm cả thuế suất ưu đãi và thời gian miễn thuế, giảm thuế) ghi trong Giấy phép đầu tư, Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư thấp hơn mức ưu đãi theo hướng dẫn tại điểm 1 và 2, Mục I, Phần B, Thông tư này thì doanh nghiệp phần mềm có quyền lựa chọn hưởng các ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp theo hướng dẫn tại điểm 1 và 2, Mục I, Phần B, Thông tư này cho thời gian ưu đãi còn lại.
Căn cứ quy định nêu trên, ngày 30/11/2009 Tổng cục Thuế đã có Công văn số 4927/TCT-CS gửi Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh hướng dẫn thực hiện ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp đối với doanh nghiệp phần mềm.
Tổng cục Thuế đề nghị Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh căn cứ quy định tại Thông tư số 123/2004/TT-BTC và Công văn số 4927/TCT-CS để hướng dẫn doanh nghiệp thực hiện.
