Kính gửi: Cục Thuế tỉnh Hưng Yên.

Tổng cục Thuế nhận được công văn số 1089/CT-TTHT ngày 4/5/2012 của Cục Thuế tỉnh Hưng Yên về ưu đãi thuế TNDN đối với Công ty cổ phần sản xuất và thương mại Vân Anh. Về vấn đề này, sau khi lấy ý kiến các đơn vị (Vụ Chính sách thuế, Vụ Pháp chế) và báo cáo Bộ Tài chính, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Tại Khoản b điểm 1 và Khoản c Điểm 2 Điều 35 Nghị định 164/2003/NĐ-CP ngày 22/12/2003 của Chính phủ quy định: "Thuế suất 20% đối với cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư tại địa bàn quy định tại Danh mục B Phụ lục ban hành kèm theo Nghị định này; Mức thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp 20% được áp dụng trong 10 năm, kể từ khi hợp tác xã và cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư bắt đầu hoạt động kinh doanh".

Tại Điểm 4 Điều 36 Nghị định số 164/2003/NĐ-CP quy định: "Được miễn thuế 02 năm, kể từ khi có thu nhập chịu thuế và giảm 50% số thuế phải nộp cho 06 năm tiếp theo đối với cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư tại địa bàn quy định tại Danh mục B và cơ sở kinh doanh di chuyển đến địa bàn quy định tại Danh mục B Phụ lục ban hành kèm theo Nghị định này".

Về thủ tục, hồ sơ làm căn cứ để xác nhận ưu đãi đầu tư: Theo quy định của pháp luật về đầu tư thời điểm trước ngày 01/07/2006 (thời điểm Luật Đầu tư có hiệu lực thi hành), tại tiết a khoản 1 Điều 43 Nghị định số 51/1999/NĐ-CP ngày 08/07/1999 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Luật khuyến khích đầu tư trong nước (sửa đổi) quy định: "Thủ tục xét, cấp ưu đãi đầu tư cho nhà đầu tư tại địa phương:

Thủ tục xét, cấp ưu đãi đầu tư cho nhà đầu tư nói tại khoản 1 Điều 41 của Nghị định này được thực hiện như sau:

1. Nhà đầu tư gửi hồ sơ đăng ký ưu đãi đầu tư đến Sở Kế hoạch và Đầu tư a) Đối với dự án đầu tư thành lập doanh nghiệp mới, hồ sơ đăng ký ưu đãi đầu tư bao gồm.

Hồ sơ đăng ký thành lập doanh nghiệp theo quy định của pháp luật;

- Đơn đăng ký ưu đãi đầu tư lập theo mẫu quy định;

- Dự án đầu tư hoặc phương án kinh doanh;

- Bản sao hợp lệ Quyết định đầu tư đối với dự án có sử dụng vốn ngân sách Nhà nước;

Danh mục máy móc, thiết bị và phương tiện vận tải chuyên dùng phải nhập khẩu (nếu có) để thực hiện dự án đầu tư".

Tại khoản 1 Điều 38 Luật Đầu tư số 59/2005/QH11 có hiệu lực thi hành từ ngày 01/07/2006 quy định thủ tục thực hiện ưu đãi đầu tư: "1. Đối với dự án đầu tư trong nước thuộc diện không phải đăng ký đầu tư và dự án thuộc diện đăng ký đầu tư quy định tại Điều 45 của Luật này, nhà đầu tư căn cứ vào các ưu đãi và điều kiện ưu đãi đầu tư theo quy định của pháp luật để tự xác định ưu đãi và làm thủ tục hưởng ưu đãi đầu tư tại cơ quan nhà nước có thẩm quyền. Trường hợp nhà đầu tư có yêu cầu xác nhận ưu đãi đầu tư thì làm thủ tục đăng ký đầu tư để cơ quan nhà nước quản lý đầu tư ghi ưu đãi đầu tư vào Giấy chứng nhận đầu tư".

Theo quy định tại khoản 1 Điều 45 Luật Đầu tư số 59/2005/QH11 quy định thủ tục đăng ký đầu tư đối với dự án đầu tư trong nước thì "Đối với dự án đầu tư trong nước có quy mô vốn đầu tư dưới mười lăm tỷ đồng Việt Nam và không thuộc Danh mục lĩnh vực đầu tư có điều kiện thì nhà đầu tư không phải làm thủ tục đăng ký đầu tư”

Căn cứ các quy định nêu trên, trường hợp Công ty cổ phần Sản xuất và Thương mại Vân Anh được Sở Kế hoạch và Đầu tư tỉnh Hưng Yên cấp giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh lần đầu số 0503000158 ngày 04/4/2006 lần đầu với ngành nghề kinh doanh chủ yếu là sản xuất, kinh doanh thiết bị văn phòng, sách báo, đồ nội ngoại thất, gia dụng...Tại thời điểm thành lập tháng 4/2006, Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh của Công ty cổ phần Sản xuất và Thương mại Vân Anh với mức vốn đầu tư (tự kê khai) là một tỷ năm trăm triệu đồng, nếu thực tế Công ty thành lập mới tại địa bàn có điều kiện kinh tế xã hội khó khăn thuộc Danh mục B ban hành kèm theo Nghị định số 164/2003/NĐ-CP ngày 22/12/2003 của Chính phủ (huyện Tiên Lữ, tỉnh Hưng Yên) thì Công ty cổ phần Sản xuất và Thương mại Vân Anh được hưởng ưu đãi thuế TNDN đối với cơ sở kinh doanh mới thành lập theo các điều kiện thực tế đáp ứng ưu đãi đầu tư quy định tại các văn bản quy phạm pháp luật về thuế thu nhập doanh nghiệp.

Đề nghị Cục Thuế căn cứ vào quy định của pháp luật và điều kiện thực tế tại thời điểm thành lập của đơn vị để hướng dẫn đơn vị theo quy định; đồng thời Cục Thuế báo cáo UBND tỉnh Hưng Yên xem xét theo trách nhiệm thực hiện quản lý nhà nước về đầu tư trên địa bàn xử lý những vướng mắc và vi phạm pháp luật về đầu tư (nếu có) của Công ty cổ phần sản xuất và thương mại Vân Anh về thủ tục đăng ký đầu tư ./.